MTs Al fat-hiyah didirikan oleh KH Harun Al Rasyid (Alm), tujuan didirikannya untuk memenuhi harapan masyarakat yang ingin mendidik anaknya untuk mengerti ajaran Agama Islam, dan mengetahui pelajaran umum. didirikan dibawah naungan Yayasan Pesantren Da'wah Islamiyah (kini bernama Yayasan Al fat-hiyah Harun Al Rasyid) pada tahun 1994, seiring berjalannya program Madrasah, kini MTS Al fat-hiyah telah terakreditasi A. Kurun waktu tahun 2012-2013, MTs Al fat-hiyah mendapat pembinaan dari CTLD (central Teaching and Leaderhip Development) UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, sebagai lanjutan dari kemitraan antara Kementerian Agama Republik Indonesia dengan Kementerian Pendidikan Australia, melalui program Australia AID, dan perkembangan Madrasah MTs Al fat-hiyah pada kurun waktu tersebut sangat dirasakan manfaatnya oleh warga Madrasah dan Masyarakat sekitarnya, jelang akhir tahun 2013 MTs Al Fat-hiyah berhasil memperoleh status Akreditasi A, dengan nilai sangat memuaskan.